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東洋食品研究所 > 研究報告書 > 第27号(2006-2008)

Bacillus coagulansの16S-23S rDNA ITS領域の多型解析

(著者:遠田昌人,田口憲人)

Bacillus coagulans の13菌株について16S-23S rDNA ITS領域の塩基配列を詳細に調査した.いずれの菌株もITS-PCRで複数の鎖長の異なる増幅産物を生じ、主要な産物は5種類であった.増幅産物のうち供試全菌株で共通にみられたのは403bpの増幅産物のみであった.

アライメントの結果、増幅産物は7つの部分配列から成り、いずれかの欠失によりバリエーションを生じていた.共通産物である403bp産物の塩基配列に基づき、B. coagulans を特異的に検出あるいは同定可能なPCRプライマーセット101-22F/264-21Rを構築した.

キーワード:Bacillus coagulans,ITS,PCR,多型性,迅速同定.

東洋食品工業短大・東洋食品研究所 研究報告書,27,77-83(2009)

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